J'ai sans doute mal compris votre problèmes car moi, je ne vois pas le souci. Je viens de faire des essais avec des poutres en bois d'une famille venant avec Revit et celles-ci se coupent selon un plan de référence et s'ajustent via la commande "modifier/Ajuster" sans problème.
Après quelques tests il est apparu que la famille de poutre que nous utilisons générait l'extrusion sous le plan de référence, ce qui est tout à fait logique mais nous limitait dans les découpes dans le sens longitudinal de ces poutres lorsque nous travaillions sur du bois. En revanche aucun souci pour les coupes transversales ou les ajustements.
En effet lors d'une coupe selon un plan Revit conserve la matière située entre le plan de coupe et le plan de référence. Du coup un plan de coupe passant par le centre du plan de référence génère donc un volume nul, d'où mon erreur.
La solution : une nouvelle famille de poutre dont le plan de référence se situe sous l'extrusion et le tour est joué !